发布时间:2023/2/16
在前期推送里,我们已经给大家分享了寡核苷酸的荧光基团、淬灭基团修饰,间臂类修饰和特殊碱基修饰。本文是寡核苷酸修饰系列的最后一篇,将给大家分享寡核苷酸化学修饰的应用。以下为一个简略版的表格,具体的例子与结构我们文章里见。
发布时间:2023/1/5
前两期我们分享了寡核苷酸的荧光基团、淬灭基团修饰,以及间臂类修饰。本期推送将和大家分享寡核苷酸中特殊核苷酸的作用。在常见的A、T、G、C、U基础上,仅仅做了一点改变,或是某个原子的取代,或是某个基团的添加和缺失,但是却给寡核苷酸性质带来比较大的变化,赋予寡核苷酸新的功能。
发布时间:2022/12/22
腺相关病毒(AAV)是目前应用最为广泛且最为重要的体内基因治疗载体。它们可以传递高达4.7 kb的遗传负载,并能感染广泛的细胞类型,而且几乎没有致病性。AAV的生产过程以构建质粒为起始,到包装成病毒颗粒结束(图1)。由于AAV基因组的结构特征,制备具有高保真DNA的AAV病毒是很困难的。基于此,安升达提供一站式的AAV基因组测序质检方案,优化AAV载体的质量。
NGS药企合规服务:CAR-T慢病毒整合位点分析(LM-PCR扩增法)
发布时间:2022/12/1
近年来,嵌合抗原受体T(chimeric antigen receptor T,CAR-T)细胞疗法因在血液肿瘤中的突出疗效已成为肿瘤细胞免疫治疗领域中新的研发热点。但是该疗法所使用的慢病毒载体介导的基因转导可能存在一定的潜在风险:慢病毒在细胞基因组的整合可能引起原癌基因的激活、抑癌基因的失活、RNA 剪接、基因融合等,从而具有成瘤风险。根据国家药品监督管理局药品审批中心(CDE)发布的《基因修饰细胞治疗产品非临床研究与技术指导原则》,慢病毒外源序列在基因组的整合位点及安全风险评估是CDE放行的重要因素。
发布时间:2022/11/24
提到寡核苷酸的spacer修饰,很多小伙伴可能比较陌生,它们不像荧光、硫代、biotin修饰等赋予寡核苷酸显而易见的特点;但是在许多生物、化学应用中,使用合适的spacer,会帮助我们收获更漂亮的结果。本文将给大家分享常见的spacer种类与应用实例,让我们共同学习、探讨spacer的使用。
发布时间:2022/11/3
上一次的专题中,我们罗列了学术界几类主流的CRISPR脱靶检测方法,它们原理各不相同,能够找到的脱靶位点也有所区别。在实际应用中,如何选择CRISPR脱靶检测方法,如何选择用于检测的细胞,发现脱靶位点后又如何进行评估,都是需要重点关注的问题。接下来,我们将以几个前沿的CRISPR临床实验为例,阐述一下CRISPR临床实验中的脱靶风险评估策略。
发布时间:2022/10/27
目前市面上常用的三代测序为Pacific Bioscience的SMRT技术和Oxford Nanopore Technologies公司的纳米孔单分子测序技术,这些技术的出现,大大提升了基因组组装的效率。而除了基因组组装之外,利用其技术优势,在很多方面都得到了有效利用。下面就为大家介绍基于这两种测序平台的主要应用方向。
发布时间:2022/10/21
微孔板作为一种便捷的样品存储、运输、反应的实验耗材,在实验室中非常常见,但其在密封处理中经常存在密封不严的困扰,导致样品蒸发、溢漏或污染。因此为微孔板选择正确的微孔板密封膜对于得到最佳的实验室结果并避免在下游进行不必要的工作非常重要。热密封提供了一种 100%有效的孔板密封方法,可实现完全的密封,使用快速且经济高效。今天我们将分享两种使用热密封技术的膜。
CRISPR Screen 操作解析:Nature 高分文章你也可以写
发布时间:2022/9/29
基因的功能研究一直是生物学研究的核心,建立合适的遗传筛选体系,是基因功能研究的最佳手段。最早的辐射和化学诱变就是经典的正向遗传学方法,基于表型筛选出基因组上的随机突变,寻找表型和基因的联系。基因诱变法在生物学研究的初期帮助我们解析了很多基因的功能,但是表型筛选的工作量巨大,还需要进行繁琐的杂交实验来确定基因位置和序列,在生物学研究逐步进入基因组学时代后,正向遗传学方法逐渐被淘汰。
发布时间:2022/9/22
安升达已有13年引物合成经验,拥有国际先进的高通量DNA合成仪、专业的技术人员及成熟的合成纯化方法,能及时为您提供高质量、多种类的引物合成服务。普通引物、修饰引物、RNA引物、文库引物、NGS建库引物、DNA编码化合物库(DEL)等,一应俱全。保证一流的质量和及时的交货时间。同时我们拥有严格的质量检测体系,采取“控制前移”的质量手段,通过严格的供应商质量管理体系、严密的生产过程中间控制和安全快捷的物流服务选择等方式控制整个生产过程,以保证产品质量满足客户的要求。
发布时间:2022/8/18
慢病毒是以HIV-1发展起来的一种病毒载体。在数十年的应用中,慢病毒也不断地优化了其生物安全性和有效性,目前已经成为体内外生物实验中一种功能非常强大的基因传递工具。在基因传递方面,慢病毒拥有其诸多独特的优势:稳定持久表达、可感染多种类型细胞、可携带大片段基因、免疫原性比较低及不易诱发宿主免疫反应等。无论是基础科研还是临床研究,慢病毒载体都具有非常广泛的应用前景。今天,小编为大家总结了近些年来慢病毒的应用热点。
发布时间:2022/7/28
生物医药是保障国民健康的高新技术产业,也是《“十四五”生物经济发展规划》中明确提出的重点布局方向之一。规划中将“面向人民生命健康的生物医药”作为生物经济4大重点领域之一,加快生物医药创新升级,并对推动医疗健康产业快速发展。在技术及时代的潮流推动下,我国创新药物研发及其相关的技术平台体系建设实现了前所未有的发展,医药科技和产业实力在不断增强、地位也逐渐升高。
发布时间:2022/7/21
CRISPR/Cas9技术自问世以来,迅速发展,成为生物学中的热门研究领域,现代生物学已将其广泛应用在基因编辑领域。CRISPR/Cas9技术是继锌指核酸酶(zinc-finger nuclease, ZFN)、转录激活样效应物核酸酶(transcription activator-like effector nucleases, TALENs)等技术后最为重要的基因改造技术,可以在基因敲入、基因敲除、基因激活、基因沉默、表观遗传修饰及3D基因结构改变中进行广泛的应用。早在2013年,CRISPR/Cas9技术就被《科学》列为年度十大科技进展之一,是发展最为迅猛的基因编辑技术。CRISPR/Cas9技术不仅同时靶向多个靶点,切割效率高,而且设计简单,识别不受基因组甲基化影响,适应面广,使其优势更明显。
mRNA疫苗这么火,来看看mRNA poly(A)质粒如何快速合成和稳定制备?
发布时间:2022/7/20
新冠爆发以来,mRNA疫苗和治疗药物研究如火如荼。mRNA疫苗,是将合成的编码蛋白质抗原的mRNA序列注入人体内,指导机体表达相应的蛋白质,并诱导机体激发特异性免疫应答,达到疾病预防和治疗的目的[1]。与传统疫苗相比,具有免疫原性强、安全性高且易研发与生产等优点。mRNA疫苗近几年如雨后春笋般涌现,目前各类mRNA疫苗在基础研究和临床研究方面都取得了突破性进展。在病毒传染病如新冠病毒、流感病毒、HIV、狂犬病病毒等、免疫肿瘤学(IO)、个性化癌症(PCV)、遗传性疾病和罕见疾病等领域的应用。
发布时间:2022/6/30
近几年,细胞和基因治疗(cell & gene therapy,CGT)领域发展迅猛,在多个方向取得了重大突破,以anti-CD19和BCMA为代表的多种CAR-T免疫细胞疗法攻克了一部分血液瘤,多种AAV疗法也给一些难以成药的罕见病提供了有效的治疗方案。另一方面,基于CRISPR基因编辑技术的众多基因疗法也进展迅速,首个体外基因编辑疗法最快今年年底能够上市(CRISPR Therapeutics CTX001)[1],体内基因编辑疗法取得了不错的临床数据(Intellia Therapeutics NTLA-2001)[2],使用CRISPR技术制造的通用型CAR-T疗法也是免疫细胞疗法发展的一大趋势(Caribou Biosciences CB-010)
发布时间:2022/6/24
自1975年Kohler和Milstein发现单克隆抗体杂交瘤技术,就已逐渐成为制备单抗的主要技术之一。杂交瘤技术是将骨髓瘤细胞与免疫的动物脾细胞融合,形成能分泌针对该抗原的均质的高特异性的抗体—单克隆抗体。
发布时间:2022/6/16
新冠疫情依旧蔓延,作为防控疫情的重要方案,大规模核酸筛查成为整个防控工作中的重中之重。安升达作为全球的生命科学领域的解决方案提供者,可为新冠核酸检测提供多种配套的设备和耗材,极大地提高了核酸筛查的效率,缩短了工作时长,降低了人员的工作负荷,全面助力新冠疫情检测。本次主要是介绍试剂安全运输和存储中,经常会用到的一款铝箔膜。
发布时间:2022/5/26
自1961年信使RNA(mRNA)首次被发现以来,各种临床应用不断拓展。递送技术与修饰技术的不断成熟,也推动了mRNA技术相关研究的加速发展。2020年新冠疫情爆发,以体外合成RNA为原料的mRNA疫苗,凭借其安全有效、易合成生产、能快速应对突变毒株等优点,受到全球广泛的关注。两款mRNA疫苗的上市也宣告mRNA技术正式进入商业化时代。
发布时间:2022/5/12
qPCR全称是荧光定量PCR(Realtime fluorescence quantitative PCR),也称作实时荧光定量PCR,凭借其高精度、可定量等优势,是现阶段分子诊断主流技术平台,临床诊断的“金标准”,尤其广泛应用于感染性疾病(病毒性肝炎、性病和其他病菌/病毒类等)和肿瘤伴随诊断领域。然而,qPCR其中涉及的化学原理与数学原理大家都清楚么?今天,我们就和大家详细地聊一聊。
发布时间:2022/4/02
近期随着上海等地的新冠疫情蔓延,作为防控疫情的重要方案,大规模核酸筛查成为整个防控工作中的重中之重。安升达作为全球的生命科学领域的解决方案提供者,我们为新冠核酸检测提供多种配套的设备和耗材极大的提高了核酸筛查的效率,缩短了工作时长,降低了人员的工作负荷,全面助力新冠疫情检测。
发布时间:2022/3/24
腺相关病毒(AAV)是目前基因治疗领域的“明星”载体,然而由于其自身结构的特点,使得对AAV载体的研究具有一定的挑战。AAV基因组的两端包含两个145bp的反向末端重复序列(ITR),这会形成一种高度稳定的T型发夹结构,它在病毒的复制和包装过程中起到了关键的作用。然而这种特殊结构对于AAV质粒生产和QC过程产生了不小的挑战。
发布时间:2022/1/13
2021年,两位CRISPR的技术先驱创立的基因治疗公司先后披露了基因编辑治疗的临床数据,张锋创立的Editas Medicine通过敲除基因CEP290的部分内含子序列来治疗Leber先天性黑蒙10型[1],Jennifer Doudna创立的Intellia Therapeutics则是通过移码突变基因TTR来治疗转甲状腺素蛋白淀粉样变性(ATTR)[2]。
发布时间:2021/12/7
治疗性抗体已成为近年来新药开发的主要类别。在过去五年中,抗体也成为医药市场上最畅销的药物。2018年,全球治疗性单克隆抗体市场价值约1152亿美元,预计到2025年将产生3000亿美元的收入。随着新药被批准用于治疗各种人类疾病,包括癌症、自身免疫、代谢和传染病,治疗性抗体药物的市场经历了爆炸性增长。
发布时间:2021/11/11
此次席卷全球的新冠疫情让人们认识到了疫苗的重要性。如果说,免疫系统是御病毒于体外的“万里长城”,那单克隆抗体就是辅助人体围歼病毒的“尖兵利器”。抗体发现和疫苗开发对人类生存的意义不言而喻,抗体除治疗感染疾病外,在癌症以及自身免疫性疾病等领域也发挥重要作用。
发布时间:2021/10/21
CRISPR/Cas9技术自2012年发表以来,基因编辑技术获得了飞速发展。相比于上一代的基因编辑技术ZFN和TALEN,CRISPR/Cas9技术最大的优势是由RNA引导进行核酸内切。相比于ZFN和TALEN需要进行复杂的蛋白序列重编程,CRISPR/Cas9只需要进行sgRNA的重编程,就可以完成对不同DNA序列的识别和切割。此后发现的分子量更小的CRISPR/Cas12系统和识别RNA的CRISPR/Cas13系统,进一步拓宽了CRISPR技术的应用范围。
发布时间:2021/10/15
随着2021年度诺贝尔奖各大奖项陆续公布,“诺贝尔奖”的话题再次成为了网友们关注的热点。回顾近几年的诺奖,去年的化学奖,授予了法国科学家Emmanuelle Charpentier和美国科学家Jennifer A. Doudna,以表彰其“开发了一种基因组编辑的方法”,阐述和发展了CRISPR基因编辑技术,是近年来最为重要的科学进展之一。
发布时间:2021/9/9
抗体发现和疫苗开发对人类生存的意义不言而喻,疫苗是预防控制传染病最有效的手段。而抗体除治疗感染疾病外,在癌症治疗领域也发挥重要作用。
发布时间:2021/8/27
当一场传染性疾病开始蔓延,对于这场危机的制造者杀气腾腾的病毒,我们到底了解多少呢?在技术革新快速的当今社会,很难有哪项技术可以被称之为YYDS。近年来,NGS乘风破浪,在生物研究技术中脱颖而出,展现出了极大的优势。尤其是在疑难微生物、新型菌属的鉴定,特别是新型病原微生物的暴发流行监测方面,NGS具有快速、准确和高分辨率的特点,使其成为疫病病原微生物鉴定的有力工具。
发布时间:2021/7/23
疫情之下,生物制药的研发成为焦点。在创新药领域,细胞和基因治疗是推动行业发展的两大最具革命性的应用。不同于传统的化药和大分子药作用机理,细胞和基因治疗直接靶向DNA/RNA,通过改变DNA来改变最终蛋白质的性状,为治疗大量目前无法医治的疾病提供了全新的治疗方案。
发布时间:2021/7/16
二代测序,又称为高通量测序,是一个强大的功能平台,它可以同时给数以万计的DNA分子进行测序。由于这种可以多个样本同时测序的能力,在个性化医疗、遗传疾病和临床诊断等方面,二代测序开创了革命性的领域。
发布时间:2021/6/24
Sanger测序作为一代测序的金标准,是大家最常打交道的测序方法。但是,大家拿到测序结果的时候,是不是会满脸疑惑?杂乱无章的峰图怎么看?什么是信号中断?各种峰图产生的原因又是什么?
发布时间:2021/1/21
转录因子和组蛋白通过与DNA相互作用(DNA-Protein Interaction,DPI)发挥着调控基因复制、表达、重组和修复的重要作用,在实现细胞功能的过程中至关重要。其中转录因子组合决定了细胞的增值、分化以及死亡,是表观基因组学研究的重要组成部分。
发布时间:2021/1/13
代谢处于基因、转录调控、蛋白网络的下游,相比其他水平的研究,代谢物的变化更接近表型。代谢组与其他组学相结合可以提高研究结果的说服力。从代谢组出发的贯穿组学,不仅可以研究现象,还可以研究发生原因。 上期代谢组学专题文章(代谢组入门科普~)向大家科普了什么是代谢组,并学习了大牛是如何做代谢组的。但了解了原理并非实验就能一帆风顺,于是本期专题主要罗列了一些大家咨询比较多的问题,快来看看有没有你不知道的。
发布时间:2020/11/12
2020年诺贝尔化学奖颁发给了法国和美国科学家Emmanuelle Charpentier、JenniferA.Doudna,以表彰她们“开发出一种基因组编辑方法”-即CRISPR/Cas9基因编辑技术。CRISPR/Cas9基因剪刀其实大家已经非常熟悉,而在CRISPR/Cas9技术基础上开发的单碱基编辑技术——GBE系统则是CRISPR技术新的突破,代表着未来的方向。
发布时间:2020/09/18
作为基因治疗的明星载体,腺相关病毒基因组(AAV)备受关注,但它的反向末端重复序列(ITR)能形成高度稳定的二级结构,利用现有技术很难进行序列验证。为了突破这重障碍,GENEWIZ创研自主知识产权技术,运用原创的测序方法,清晰地分析这些复杂序列,助力研发人员有效地评估ITR区域的完整性。
发布时间:2020/04/23
约翰斯·霍普金斯大学最新数据显示,全球已确诊的COVID-19的病例已超过261万例,死亡病例已超过18万例,临床医生和病理学家正在努力了解SARS-CoV-2对人体所造成的损害。根据当前研究显示,SARS-CoV-2能够由肺入侵到其他器官,包括肺、心、肾、脑、肠等8大器官,并几乎能造成毁灭性损害。
发布时间:2020/01/03
基因治疗(Gene Therapy)是指将外源基因导入靶细胞,以纠正或补偿因基因缺陷或基因表达异常引起的疾病。腺相关病毒(AAV)作为基因治疗的一种明星载体,对于人类攻克癌症或更多的重大疾病有着巨大的潜力。(AAV载体更多详细内容请参见:基因治疗的好帮手—腺相关病毒)
发布时间:2019/11/15
腺相关病毒基因组(adeno-associated virus, AAV)的反向末端重复序列(inverted terminal repeat, ITR)能形成高度稳定的二级结构,利用现有技术很难进行序列验证。为了突破这重障碍,GENEWIZ研发了一种自主知识产权技术,运用原创的测序方法,清晰地分析这些复杂序列,助力研究人员有效地评估AAV-ITR区域的完整性。
发布时间:2019/07/05
肿瘤是严重危害人类生命健康的重大疾病,如何突破肿瘤治疗一直困扰着医疗界。从传统的手术治疗、化疗及放疗等治疗方法到目前基因治疗的问世,人们一直在不断的寻找治疗肿瘤的最佳方法。如何取得安全有效的转基因治疗手段,实现人类疾病基因治疗的目标,是攻克肿瘤治疗的主要考虑之一。
发布时间:2019/07/04
蛋白标签(protein tag)是指利用DNA体外重组技术,与目的蛋白一起融合表达的一种多肽或者蛋白,以便于目的蛋白的表达、检测、示踪和纯化等。随着技术的不断发展,研究人员相继开发出了具有各种不同功能的蛋白标签。 由于蛋白标签的不同特性,人们在质粒构建时常常遇到多种问题,那么今天小编就来谈谈蛋白标签的那些事。
发布时间:2019/04/04
研究者发现CYP4Z1及其假基因CYPZ2P均在乳腺癌中高表达,且它们通过假基因CYP4Z2P介导的竞争性内源RNA(ceRNA)网络促进乳腺癌血管生成及肿瘤干细胞样特性;组织芯片分析发现转录因子six2也在乳腺癌中高表达,且six2可促进CYP4Z2P及CYP4Z1的表达。由此研究者设想:Six2可通过增强CYP4Z2P介导的ceRNA网络发生促进乳腺癌肿瘤干细胞样特性,导致乳腺癌对阿霉素产生耐药。
发布时间:2019/03/22
慢病毒(lentivirus , LV)是目前细胞及模式生物实验中非常有效的工具,在基因转染方面有着许多独特的优势,例如:对分裂细胞和非分裂细胞均能够有效感染,可容纳较大基因片段,同时能够将携带的基因稳定的整合到基因组中等优势。
发布时间:2019/03/15
当我们拿到测序结果后,随之而来的问题就来了?何必因为不会分析Sanger测序结果而烦恼?今天,我们来为大家介绍一下几种常见的测序结果特点及解决方案。
发布时间:2018/12/06
固有免疫系统是宿主抵抗病原体入侵的第一道防线,固有免疫细胞能够通过模式识别受体(PRRs)识别病原体相关的分子模式(PAMPs),PRRs识别并结合PAMPs后,激活下游信号,经过信号转导诱导I 型干扰素等免疫介质大量产生。I 型干扰素(type I IFN)与细胞膜上的I 型干扰素受体结合,活化与之偶联的激酶,通过JAK-STAT信号转导途径激活下游干扰素诱导基因(ISGs)转录,而ISGs在抗病毒反应中发挥着重要作用。
发布时间:2018/10/10
中科院天津工业生物所郑平研究员和孙际宾研究员的团队合作,理性设计并构建了高效利用甲醇的甲醇依赖型谷氨酸棒杆菌,实现转化甲醇合成谷氨酸。其中,甲醇利用相关基因由金唯智合成,是构建甲醇生物利用途径的基础。
发布时间:2018/8/07
诸如上述生命奥秘的解析,往往是由于机体内部调控或在外界环境的影响下,导致DNA在序列不发生改变的情况下,基因表达却发生了改变,从而引起生物体表型发生变化(如破茧成蝶等),即表观遗传学的范畴。表观遗传学不仅涉及到生命奥秘的探索,也涉及到生活的方方面面,如美味的食物如何悄无声息地影响着健康?生活或工作的压力是怎样困扰我们的睡眠?疾病为什么会发生,以及是如何进一步肆虐我们的身体?我们又是如何一步步走向变老?……
发布时间:2018/7/26
继《我不是药神》电影后,长生生物的疫苗事件又引爆了朋友圈,让医药行业再次成为大众焦点。狂犬疫苗生产记录造假、“百白破”检验不符合规定,“问题疫苗”事件的持续发酵,将疫苗的安全问题推上风口浪尖,然而持续躺枪的不仅仅是国产疫苗,而是所有疫苗。
发布时间:2018/4/20
中国药物研究和产业发展正进入创新跨越新阶段,当前新药研发所需的知识、方法和技术更加深入,类似DNA编码化合库合成、高通量测序、免疫组库以及基因编辑等技术,深度融入药物研发,催生了药物研发的新策略、新方法和新技术。
发布时间:2018/4/19
前面,我们跟大家分享了密码子优化问题的由来、定义与相关进展等内容。在生命科学研究中,如何优化一条基因序列,使之大量表达出所需要的蛋白质是小伙伴们面临的一个基础问题。
发布时间:2018/4/19
基因组编辑技术CRISPR/Cas9自2013年被《科学》杂志列为年度十大科技进展之一以来,受到越来越多的科研工作者的高度重视,成为基因敲除和基因敲入的主要研究手段。
发布时间:2018/4/17
通过对16S/18S/ITS 等微生物物种特征序列的扩增及高通量测序,结合专业的生物信息分析,可以快速准确地鉴定样品中微生物( 细菌/ 真菌/古菌/藻类等 )的物种组成和多样性情况,并同时获得群落进化关系、物种结构、群落功能等多种生物信息,该方法广泛应用于微生物种群的多样性研究。
发布时间:2018/3/14
提起HeLa细胞,学生物的你一定不陌生。这是一种宫颈癌细胞的细胞系,被广泛应用于肿瘤研究、生物实验或者细胞培养。但是,HeLa细胞又有着许多的传奇故事,你知不知道呢?
发布时间:2017/2/8
通过上一篇文章《三文读懂PCA和PCoA(一)》的学习,我们对PCA和PCoA有了较为深刻的理解,我们了解到“PCA是基于样本的相似系数矩阵(如欧式距离)来寻找主成分,而PCoA是基于距离矩阵(欧式距离以外的其他距离)来寻找主坐标”。
发布时间:2017/2/1
在微生物NGS测序领域的高分文章中,PCA(主成分分析)和PCoA(主坐标分析)会很常见。甚至在RNA分析领域,很多研究和文章也会依据基因的表达量作PCA和PCoA分析。
发布时间:2017/12/1
11月29日,《Nature》在线发表了题为“A semi-syntheticorganism that stores and retrieves increased genetic information”的研究论文,来自美国的Romesberg团队通过扩展基因编码,在培养的细菌中增加了一对人造碱基对,首次实现非天然碱基在活细胞中编码蛋白质。
发布时间:2017/11/29
前不久,Nature News推出“The most popular genes in the human genome”,列出了人类基因组研究“最火爆”的基因清单,揭示了生物医学研究的重要趋势。